Dal 12 settembre 2006 è on line il nuovo sito del CIPMO (www.cipmo.org). Il sito, dopo una totale ristrutturazione grafica e tecnica nella quale il Centro ha investito notevoli risorse, rappresenta sempre di più il punto di riferimento in Italia per tutti coloro che intendano approfondire le tematiche mediorientali, con un approccio critico e costruttivo.

Nel sito CIPMO è confluita anche l'esperienza di Paceinmedioriente.it, sito di Maurizio Debanne, giornalista ed esperto del conflitto israelo-arabo-palestinese, che da tempo collabora con il Centro.

Il nuovo sito CIPMO si presenta come una testata on line, regolarmente registrata al Tribunale della Stampa, dalla doppia veste di quotidiano e di rivista di approfondimento, diretta da Janiki Cingoli, laddove Maurizio Debanne è il Caporedattore.

Le sezioni di Attualità e Rassegna Stampa, italiana e straniera, sono aggiornate quotidianamente, mentre quella sugli approfondimenti è composta dale analisi periodiche del direttore del CIPMO, Janiki Cingoli, e degli esperti del comitato scientifico CIPMO: giornalisti delle maggiori testate italiane, studiosi e docenti universitari. Dei loro commenti è fatta anche la Newsletter del Centro, incentrata ogni volta su un tema di particolare attualità e inviata ad una serie di contatti che comprendono: policy maker, diplomatici, esperti del Medio Oriente, studiosi e giornalisti. 

Il nuovo design è studiato per rendere più agevole la navigazione e immediato il reperimento delle informazioni ai sempre più numerosi visitatori del sito.